Ngày nay, kính hiển vi có thể bao gồm nhiều loại từ các kính hiển vi quang học, kính hiển vi sửa điện tử, kính hiển vi quỳnh quang, hay các loại kính hiển vi ký thuật số, hoặc các kính hiển vi phát xạ quang... Kính hiển vi được sử dụng rộng rãi trong nhiều ngành như vật lý, hóa học, sinh học...