1.Tại sao nhóm của Cloud lại lấy cắp Huge Material trong khi nó cần cho kế hoạch cứu Planet của Shinra???(cụ thể nhất là kế hoạch phóng Rocket nhằm ngăn chặn Meteor??)
2.Làm sao Shinra có thể đưa khẩu súng khổng lồ SisterRay từ cảng Junon lên đến tận "thành phố bay" Midgar,trong khi họ không có phương tiện bay nào đủ lớn cho việc vận chuyển nó theo đường hàng không?
3.Cái tên "Sister Ray" có từ khi nào?Theo lời Scarlet thì nó được đổi tên từ khi Diamond Weapon tấn công lần thứ 2,còn trước đó được Rufus gọi là Material Weapon,nhưng thực tế ở đoạn tát nhau giữa Tifa và Scarlet,cái tên này đã được sơn trên nòng của nó?vậy ý nghĩa thực chất của lời Scarlet là gì?
4.Con Weapon thứ nhất tên là gì?
5.Có tình tiết nào chứng tỏ Zack đã từng bị nhốt chung với Cloud trong phòng thí nghiệm của Hojo?Có thật là do ảnh hưởng các cuộc thí nghiệm này mà Cloud mang 1 phần kí ức của Zack?(Nếu theo cảm tính chủ quan của người chơi thì việc này là do Cloud tự ảo tưởng mình là 1 thành viên ưu việt của Soldier,sau đó do bị ảnh hưởng của Mako mà lẫn lộn giữa ảo tưởng và thực tế,giả thuyết này có vẻ hợp lí hơn.)