_Boss cuối là Signas (Signas chứ không phải signal nhá, cẩn thận chính tả trong game)
_Vẫn cho Colonel hồi sinh nhưng đó sẽ là bàn phụ sau khi đã giải quyết được 1/2 số Maverick (y hệt như hồi X4 - đánh xong 4 con boss thì sẽ bem Colonel)
_Khi Signas tạo phản, transform thành Colonel thì sẽ có một số skill + tactics khác so với Colonel (cái này thì trăm sự nhờ bạn rồi)
_Form 1 của Signas sẽ là Colonel, còn form 2 của nó thì mình vẫn chưa nghĩ ra. Hay là sau khi hạ xong form 1, anh ấy sẽ biến thành Maverick Zero form (tại trong cốt truyện của lex thì đã có sẵn DNA của Maverick Zero rồi)
_Không biết có nên cho form thứ 3 của boss vào không
_Cốt truyện vì thay boss cuối nên có một số chỉnh sửa như thế này: sau khi Axl bị thương (và cho vào viện cho đến hết game

), 1 vài tháng sau sự kiện của X8 trên thế giới đột nhiên xuất hiện các Maverick đã từng bị Maverick Hunter tiêu diệt
_Dần dần về sau, khi X và Zero đi tiêu diệt tiếp các Maverick và thu thập dữ liệu cho Alia để phân tích, Signas thường có những biểu hiện bất thường (cái này bạn tự chém ra, mình không giỏi phần này lắm)
_Sau khi đã tiêu diệt tất cả các Maverick, đột nhiên Signas biến mất. Trước khi biến mất, Signas có để lại 1 tọa độ
_Lần theo tọa độ đó, X và Zero đến 1 nơi bí ẩn, và sau đó chạm mặt Gate
_Sau khi đánh bại Gate, X và Zero đã khám phá ra âm mưu của Signas qua Gate. Trong suốt bao năm, Signas đã lợi dụng Maverick Hunter nhằm thu thập các dữ liệu về X và Zero để nhằm thâm tóm thế giới, tiêu diệt con người, tạo nên một thế giới của riêng Reploid
_Tuy không thể phân tích được dữ liệu của X, nhưng sau sự kiện của X6, Signas đã có được DNA của Zero
_Sau sự kiện của X8, Signas đã có được copy chip của Reploid thế hệ mới, từ đó hắn có được đầy đủ những gì cần thiết để thực hiện mưu đồ của mình
_Trước khi nổ tung, Gate đã kịp nói cho X và Zero biết vị trí của Signas hiện giờ và khuyên X và Zero sớm ngăn chặn Signas để bảo vệ loài người
_Sau khi đánh bại Signas, Signas đã nói cho X và Zero biết rằng có một thế lực nữa đứng sau hắn ta, và hắn ta sẽ sớm được báo thù
_Đứng trên đống đổ nát, X suy nghĩ về cuộc chiến giữa các Reploid, và thề sẽ quyết tâm tìm ra giải pháp để con người và Reploid có thể chung sống hóa bình. Zero cũng hứa sẽ sát cánh cùng X để bảo vệ loài người
_Sau đó màn hình tối dần và credit
Ai có góp ý gì về cốt truyện này thì cứ nói nha
